Genom sin medverkan i första omgången av Beck-filmerna blev Michael Nyqvist känd för allmänheten. Tidigare hade han studerat vid Teaterhögskolan i Malmö. 

Michael är idag en del av den fasta ensemblen på Kungliga Dramatiska Teatern, men han har haft några stora roller i flera svenska filmer. Bland annat så spelade han rollen som Mikael Blomkvist i Stieg Larsson-triologin (2009), huvudrollen i Så Som I Himmelen (2004) och tidigare så belönades han med en Guldbagge för insatsen i Grabben I Graven Bredvid (2002). 

Under 2011 gjorde Nyqvist sina första Hollywoodroller och fick, i Abduction (2011), spela mot bland annat Taylor Lauther.

Michael Nyqvist har också medverkat i filmer som Bröllopsfotografen (2009), Wallander - Mastermind (2005), Änglavakt (2010), Smala Sussie (2003), Tillsammans (2000), Arn - Tempelriddaren (2007) och Underbara Älskade (2006).