I "Pollock" samarbetar Madigan för fjärde gången med sin make Ed Harris. Tidigare har de tillsammans gjort den två timmar långa TV-filmen "Riders of the Purple Sage" baserad på Zane Greys roman med samma namn, de spelade mot varandra i Robert Bentons Oscarvinnande "En plats i mitt hjärta" och i Louis Malles "Alamo Bay".

Madigan har nyligen synts i Susan Streitfelds independentfilm "Female Perversions" och i Erin Dignams "Loved" där hon bland andra spelade mot Robin Wright Penn, William Hurt och Sean Penn. För sin roll i "Loved" blev hon nominerad till en IFP West Spirit Award för Bästa kvinnliga biroll. 1986 blev Madigan nominerad till en Oscar för sin gestaltning av Gene Hackman och Ellen Burstyns arga dotter i "Twice in a Lifetime".

Hon har även medverkat i "Kärleksbreven", "Streets of Fire", "Drömmarnas fält" med Kevin Costner, "Uncle Buck" med John Candy och "The Dark Half" med Timothy Hutton. Amy Madigan har bland annat utbildat sig vid Chicago Conservatory och fick sin skådespelarträning vid Lee Strasberg Institute.

Bland hennes scenframträdanden märks rollen som Stella i Gregory Moshers version av "Linje Lusta" på Broadway.